现(xiàn)为公(gōng)安九(jiǔ)课少校(xiào)的草(cǎo)薙(tì)素子（坂(bǎn)本真绫(líng) 配音），按(àn)照课长荒(huāng)卷(juǎn)大辅(fǔ)（塾(shú)一久(jiǔ) 配音）的指示外出调查运(yùn)输(shū)机被神(shén)秘(mì)并(bìng)机的事件结(jié)果(guǒ)途(tú)中遭到巴(bā)特(tè)（松(sōng)田(tián)健(jiàn)一郎(láng) 配音）率(lǜ)领(lǐng)的武(wǔ)装(zhuāng)分(fēn)子的袭(xí)击(jī)。与此同(tóng)时(shí)，遍(biàn)布全(quán)国的交(jiāo)通管(guǎn)制系(xì)统也意(yì)外瘫(tān)痪(huàn)。一切源于前七八(bā)联(lián)合(hé)部队的长官曾我和(hé)哉(zāi)（泽(zé)木(mù)郁也 配音），他因制造(zào)难(nán)民(mín)虐(nüè)杀事件遭到国家指控，而他的下(xià)属(shǔ)坚(jiān)信这一切都(dōu)是(shì)国家阴谋(móu)。曾我不甘(gān)被污(wū)，因此试图(tú)通过网络(luò)揭露(lòu)大国的丑(chǒu)行(xíng)。素子在(zài)调查过程(chéng)中渐渐了(le)解(jiě)真相(xiàng)，而她(tā)也朝(cháo)着组(zǔ)建(jiàn)自(zì)己(jǐ)的部队迈(mài)出重(zhòng)要(yào)的一步(bù)……　　本片(piàn)为攻壳机动(dòng)队前传(chuán)“ARISE”的第(dì)二(èr)部。